一、凤阳县地方税务局内设九个股室,分别是:办公室、人事教育股、监察室、征管和科技发展股、税政股、耕地占用税和契税管理股、纳税服务股、基金(费)股、收入核算与财务管理股。
二、凤阳县地方税务局下设两个直属机构,分别是:稽查局、征收管理分局。
三、凤阳县地方税务局下设九个派出机构,分别是:城关分局、工业园区分局、临淮分局、板桥分局、总铺分局、小溪河分局、刘府分局、武店分局、大庙分局。
四、凤阳县地方税务局下设两个事业单位,分别是:电子税务管理中心、耕地占用税和契税征收服务中心。